Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHFPL3Q86UP9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHFPL3Q86UP9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHFPL3Q86UP9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms