Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2AFVQ71UI9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFVQ71UI9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms