Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYDE1Q6ZW31 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYDE1Q6ZW31 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms