Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN12Q6ZSI9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms