Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPTNQ6XPR3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPTNQ6XPR3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms