Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1R3

MSANTD2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD2Q6P1R3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MSANTD2Q6P1R3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSANTD2Q6P1R3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD2Q6P1R3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD2Q6P1R3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD2Q6P1R3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD2Q6P1R3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD2Q6P1R3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD2Q6P1R3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD2Q6P1R3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD2Q6P1R3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD2Q6P1R3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSANTD2Q6P1R3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSANTD2Q6P1R3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms