Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC70Q6NSX1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC70Q6NSX1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms