Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 375.1 ms