Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms