Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP6Q5VW22 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP6Q5VW22 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
AGAP6Q5VW22 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AGAP6Q5VW22 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP6Q5VW22 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP6Q5VW22 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP6Q5VW22 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP6Q5VW22 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP6Q5VW22 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP6Q5VW22 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP6Q5VW22 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP6Q5VW22 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP6Q5VW22 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP6Q5VW22 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP6Q5VW22 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP6Q5VW22 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP6Q5VW22 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP6Q5VW22 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP6Q5VW22 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms