Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRT3Q5FWE3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRT3Q5FWE3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRRT3Q5FWE3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms