Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NOM1Q5C9Z4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOM1Q5C9Z4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NOM1Q5C9Z4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NOM1Q5C9Z4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOM1Q5C9Z4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms