Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KHDC1Q4VXA5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KHDC1Q4VXA5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 384.2 ms