Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3L2Q3SX64 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF3L2Q3SX64 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms