Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC142Q17RM4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC142Q17RM4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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