Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIF1AQ16665 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIF1AQ16665 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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