Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDK4Q16654 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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