Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXNQ16595 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXNQ16595 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FXNQ16595 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FXNQ16595 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FXNQ16595 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FXNQ16595 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FXNQ16595 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FXNQ16595 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FXNQ16595 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXNQ16595 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXNQ16595 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXNQ16595 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXNQ16595 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXNQ16595 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXNQ16595 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXNQ16595 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXNQ16595 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXNQ16595 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXNQ16595 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXNQ16595 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXNQ16595 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXNQ16595 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXNQ16595 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXNQ16595 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXNQ16595 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXNQ16595 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXNQ16595 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXNQ16595 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXNQ16595 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXNQ16595 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXNQ16595 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FXNQ16595 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FXNQ16595 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FXNQ16595 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FXNQ16595 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FXNQ16595 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FXNQ16595 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FXNQ16595 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXNQ16595 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXNQ16595 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXNQ16595 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXNQ16595 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXNQ16595 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXNQ16595 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXNQ16595 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXNQ16595 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FXNQ16595 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FXNQ16595 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FXNQ16595 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FXNQ16595 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FXNQ16595 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FXNQ16595 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FXNQ16595 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FXNQ16595 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FXNQ16595 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FXNQ16595 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FXNQ16595 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FXNQ16595 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FXNQ16595 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FXNQ16595 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FXNQ16595 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FXNQ16595 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FXNQ16595 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FXNQ16595 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FXNQ16595 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
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FXNQ16595 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FXNQ16595 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FXNQ16595 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FXNQ16595 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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FXNQ16595 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FXNQ16595 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FXNQ16595 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FXNQ16595 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FXNQ16595 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FXNQ16595 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FXNQ16595 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FXNQ16595 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FXNQ16595 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FXNQ16595 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FXNQ16595 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FXNQ16595 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FXNQ16595 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FXNQ16595 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FXNQ16595 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FXNQ16595 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FXNQ16595 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FXNQ16595 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FXNQ16595 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FXNQ16595 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FXNQ16595 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FXNQ16595 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FXNQ16595 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FXNQ16595 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FXNQ16595 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FXNQ16595 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FXNQ16595 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FXNQ16595 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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