Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1EQ15878 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1EQ15878 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms