Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RYR3Q15413 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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