Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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