Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALCOCO2Q13137 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALCOCO2Q13137 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALCOCO2Q13137 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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