Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TNFRSF9Q07011 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms