Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD51Q06609 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD51Q06609 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD51Q06609 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD51Q06609 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD51Q06609 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD51Q06609 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD51Q06609 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD51Q06609 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD51Q06609 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD51Q06609 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD51Q06609 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD51Q06609 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD51Q06609 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD51Q06609 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAD51Q06609 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms