Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PSME1Q06323 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PSME1Q06323 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PSME1Q06323 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.5 ms