Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG3AQ06141 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
REG3AQ06141 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REG3AQ06141 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms