Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAV1Q03135 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms