Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELBQ01201 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RELBQ01201 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELBQ01201 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELBQ01201 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELBQ01201 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RELBQ01201 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RELBQ01201 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RELBQ01201 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RELBQ01201 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RELBQ01201 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RELBQ01201 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RELBQ01201 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RELBQ01201 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RELBQ01201 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RELBQ01201 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELBQ01201 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELBQ01201 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELBQ01201 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELBQ01201 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RELBQ01201 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELBQ01201 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELBQ01201 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RELBQ01201 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELBQ01201 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELBQ01201 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELBQ01201 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELBQ01201 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELBQ01201 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RELBQ01201 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RELBQ01201 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RELBQ01201 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RELBQ01201 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RELBQ01201 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RELBQ01201 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RELBQ01201 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RELBQ01201 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RELBQ01201 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RELBQ01201 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RELBQ01201 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RELBQ01201 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RELBQ01201 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RELBQ01201 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RELBQ01201 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RELBQ01201 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RELBQ01201 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RELBQ01201 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RELBQ01201 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RELBQ01201 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RELBQ01201 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RELBQ01201 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RELBQ01201 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RELBQ01201 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RELBQ01201 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RELBQ01201 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RELBQ01201 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RELBQ01201 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RELBQ01201 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RELBQ01201 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RELBQ01201 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RELBQ01201 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RELBQ01201 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RELBQ01201 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RELBQ01201 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RELBQ01201 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RELBQ01201 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RELBQ01201 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RELBQ01201 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RELBQ01201 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RELBQ01201 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RELBQ01201 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RELBQ01201 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RELBQ01201 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RELBQ01201 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RELBQ01201 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RELBQ01201 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RELBQ01201 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RELBQ01201 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RELBQ01201 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RELBQ01201 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RELBQ01201 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RELBQ01201 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RELBQ01201 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RELBQ01201 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RELBQ01201 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RELBQ01201 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RELBQ01201 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RELBQ01201 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RELBQ01201 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RELBQ01201 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RELBQ01201 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RELBQ01201 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RELBQ01201 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RELBQ01201 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RELBQ01201 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RELBQ01201 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RELBQ01201 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RELBQ01201 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RELBQ01201 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RELBQ01201 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms