Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDK5Q00535 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms