Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTA1P68133 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTA1P68133 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ACTA1P68133 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTA1P68133 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms