Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ARF6P62330 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARF6P62330 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARF6P62330 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARF6P62330 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARF6P62330 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARF6P62330 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARF6P62330 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARF6P62330 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ARF6P62330 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARF6P62330 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARF6P62330 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARF6P62330 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARF6P62330 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARF6P62330 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARF6P62330 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARF6P62330 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARF6P62330 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARF6P62330 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARF6P62330 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARF6P62330 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARF6P62330 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARF6P62330 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARF6P62330 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARF6P62330 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARF6P62330 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARF6P62330 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARF6P62330 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARF6P62330 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARF6P62330 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARF6P62330 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARF6P62330 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARF6P62330 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARF6P62330 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARF6P62330 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARF6P62330 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARF6P62330 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ARF6P62330 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARF6P62330 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARF6P62330 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARF6P62330 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARF6P62330 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARF6P62330 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARF6P62330 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARF6P62330 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARF6P62330 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARF6P62330 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARF6P62330 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARF6P62330 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARF6P62330 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARF6P62330 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARF6P62330 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARF6P62330 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ARF6P62330 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARF6P62330 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARF6P62330 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARF6P62330 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARF6P62330 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARF6P62330 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARF6P62330 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARF6P62330 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARF6P62330 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARF6P62330 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARF6P62330 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ARF6P62330 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARF6P62330 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARF6P62330 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARF6P62330 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARF6P62330 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARF6P62330 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARF6P62330 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARF6P62330 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARF6P62330 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARF6P62330 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARF6P62330 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARF6P62330 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARF6P62330 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARF6P62330 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARF6P62330 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARF6P62330 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARF6P62330 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARF6P62330 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARF6P62330 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARF6P62330 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARF6P62330 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARF6P62330 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARF6P62330 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARF6P62330 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARF6P62330 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARF6P62330 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARF6P62330 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARF6P62330 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF6P62330 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF6P62330 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF6P62330 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF6P62330 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF6P62330 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF6P62330 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF6P62330 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF6P62330 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms