Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCE1P61221 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms