Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2FP61218 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
POLR2FP61218 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2FP61218 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.5 ms