Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCDC1P59894 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCDC1P59894 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DCDC1P59894 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCDC1P59894 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms