Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEFSECP57772 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EEFSECP57772 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms