Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCL23P55773 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCL23P55773 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCL23P55773 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCL23P55773 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL23P55773 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL23P55773 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL23P55773 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL23P55773 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL23P55773 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL23P55773 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL23P55773 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL23P55773 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL23P55773 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL23P55773 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL23P55773 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL23P55773 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL23P55773 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL23P55773 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCL23P55773 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCL23P55773 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCL23P55773 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCL23P55773 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCL23P55773 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCL23P55773 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCL23P55773 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCL23P55773 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCL23P55773 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCL23P55773 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCL23P55773 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCL23P55773 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCL23P55773 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCL23P55773 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCL23P55773 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCL23P55773 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCL23P55773 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCL23P55773 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCL23P55773 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL23P55773 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL23P55773 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL23P55773 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL23P55773 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL23P55773 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL23P55773 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL23P55773 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL23P55773 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL23P55773 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCL23P55773 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCL23P55773 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCL23P55773 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCL23P55773 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCL23P55773 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCL23P55773 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCL23P55773 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCL23P55773 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCL23P55773 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCL23P55773 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCL23P55773 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCL23P55773 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCL23P55773 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCL23P55773 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCL23P55773 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCL23P55773 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCL23P55773 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCL23P55773 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCL23P55773 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCL23P55773 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCL23P55773 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCL23P55773 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCL23P55773 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCL23P55773 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCL23P55773 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCL23P55773 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCL23P55773 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCL23P55773 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCL23P55773 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCL23P55773 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCL23P55773 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCL23P55773 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCL23P55773 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCL23P55773 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCL23P55773 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCL23P55773 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCL23P55773 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCL23P55773 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCL23P55773 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCL23P55773 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCL23P55773 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL23P55773 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL23P55773 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL23P55773 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL23P55773 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL23P55773 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL23P55773 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCL23P55773 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCL23P55773 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCL23P55773 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCL23P55773 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCL23P55773 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCL23P55773 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms