Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP6P55212 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP6P55212 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP6P55212 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP6P55212 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP6P55212 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP6P55212 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP6P55212 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP6P55212 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP6P55212 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP6P55212 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP6P55212 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP6P55212 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP6P55212 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP6P55212 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP6P55212 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP6P55212 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP6P55212 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP6P55212 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP6P55212 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP6P55212 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP6P55212 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP6P55212 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP6P55212 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP6P55212 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP6P55212 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP6P55212 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP6P55212 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP6P55212 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP6P55212 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASP6P55212 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP6P55212 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP6P55212 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP6P55212 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP6P55212 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP6P55212 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP6P55212 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP6P55212 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP6P55212 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP6P55212 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP6P55212 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP6P55212 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP6P55212 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP6P55212 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP6P55212 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP6P55212 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP6P55212 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP6P55212 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP6P55212 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP6P55212 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP6P55212 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP6P55212 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP6P55212 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP6P55212 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP6P55212 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP6P55212 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP6P55212 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP6P55212 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP6P55212 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP6P55212 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP6P55212 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP6P55212 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP6P55212 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP6P55212 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP6P55212 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP6P55212 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP6P55212 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP6P55212 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP6P55212 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP6P55212 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP6P55212 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP6P55212 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP6P55212 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP6P55212 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP6P55212 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP6P55212 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP6P55212 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP6P55212 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP6P55212 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP6P55212 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP6P55212 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP6P55212 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP6P55212 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP6P55212 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP6P55212 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP6P55212 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP6P55212 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP6P55212 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP6P55212 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP6P55212 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP6P55212 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP6P55212 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP6P55212 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP6P55212 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP6P55212 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP6P55212 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP6P55212 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP6P55212 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP6P55212 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP6P55212 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms