Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CASP7P55210 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CASP7P55210 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CASP7P55210 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CASP7P55210 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CASP7P55210 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CASP7P55210 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CASP7P55210 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CASP7P55210 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CASP7P55210 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CASP7P55210 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CASP7P55210 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CASP7P55210 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CASP7P55210 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CASP7P55210 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CASP7P55210 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CASP7P55210 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CASP7P55210 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CASP7P55210 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CASP7P55210 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CASP7P55210 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CASP7P55210 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CASP7P55210 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CASP7P55210 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CASP7P55210 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CASP7P55210 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CASP7P55210 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CASP7P55210 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CASP7P55210 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CASP7P55210 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CASP7P55210 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CASP7P55210 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CASP7P55210 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CASP7P55210 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CASP7P55210 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CASP7P55210 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CASP7P55210 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CASP7P55210 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CASP7P55210 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CASP7P55210 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CASP7P55210 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CASP7P55210 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CASP7P55210 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CASP7P55210 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CASP7P55210 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CASP7P55210 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CASP7P55210 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CASP7P55210 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CASP7P55210 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CASP7P55210 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CASP7P55210 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CASP7P55210 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CASP7P55210 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CASP7P55210 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CASP7P55210 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CASP7P55210 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CASP7P55210 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CASP7P55210 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CASP7P55210 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CASP7P55210 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CASP7P55210 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CASP7P55210 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CASP7P55210 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CASP7P55210 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CASP7P55210 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CASP7P55210 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CASP7P55210 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CASP7P55210 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CASP7P55210 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CASP7P55210 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CASP7P55210 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CASP7P55210 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CASP7P55210 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CASP7P55210 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CASP7P55210 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CASP7P55210 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CASP7P55210 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CASP7P55210 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CASP7P55210 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CASP7P55210 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CASP7P55210 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CASP7P55210 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CASP7P55210 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CASP7P55210 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CASP7P55210 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CASP7P55210 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CASP7P55210 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CASP7P55210 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CASP7P55210 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CASP7P55210 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CASP7P55210 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CASP7P55210 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CASP7P55210 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CASP7P55210 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CASP7P55210 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CASP7P55210 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CASP7P55210 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CASP7P55210 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CASP7P55210 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CASP7P55210 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms