Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23AP54725 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms