Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP11P51784 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP11P51784 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP11P51784 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP11P51784 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP11P51784 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP11P51784 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP11P51784 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP11P51784 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP11P51784 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP11P51784 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP11P51784 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP11P51784 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP11P51784 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP11P51784 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP11P51784 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP11P51784 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP11P51784 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP11P51784 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP11P51784 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP11P51784 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP11P51784 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP11P51784 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP11P51784 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP11P51784 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP11P51784 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP11P51784 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP11P51784 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP11P51784 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP11P51784 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP11P51784 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP11P51784 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP11P51784 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP11P51784 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP11P51784 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP11P51784 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP11P51784 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP11P51784 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP11P51784 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP11P51784 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP11P51784 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP11P51784 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP11P51784 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP11P51784 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP11P51784 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP11P51784 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
USP11P51784 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP11P51784 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP11P51784 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP11P51784 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP11P51784 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP11P51784 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP11P51784 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP11P51784 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP11P51784 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP11P51784 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP11P51784 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP11P51784 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP11P51784 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP11P51784 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP11P51784 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP11P51784 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP11P51784 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP11P51784 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP11P51784 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP11P51784 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP11P51784 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP11P51784 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP11P51784 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP11P51784 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP11P51784 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP11P51784 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP11P51784 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP11P51784 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP11P51784 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP11P51784 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP11P51784 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP11P51784 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP11P51784 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP11P51784 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP11P51784 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP11P51784 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP11P51784 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP11P51784 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP11P51784 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP11P51784 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP11P51784 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP11P51784 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP11P51784 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP11P51784 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP11P51784 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP11P51784 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP11P51784 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP11P51784 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP11P51784 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP11P51784 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP11P51784 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP11P51784 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP11P51784 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP11P51784 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms