Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP3P50461 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRP3P50461 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms