Protein–RNA interactions for Protein: P48740

MASP1, Mannan-binding lectin serine protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MASP1P48740 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MASP1P48740 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MASP1P48740 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MASP1P48740 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MASP1P48740 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MASP1P48740 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MASP1P48740 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MASP1P48740 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MASP1P48740 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MASP1P48740 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MASP1P48740 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MASP1P48740 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MASP1P48740 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MASP1P48740 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MASP1P48740 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MASP1P48740 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MASP1P48740 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MASP1P48740 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MASP1P48740 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MASP1P48740 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MASP1P48740 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MASP1P48740 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MASP1P48740 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MASP1P48740 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MASP1P48740 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MASP1P48740 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MASP1P48740 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MASP1P48740 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MASP1P48740 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MASP1P48740 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MASP1P48740 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MASP1P48740 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MASP1P48740 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MASP1P48740 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MASP1P48740 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MASP1P48740 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MASP1P48740 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MASP1P48740 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MASP1P48740 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MASP1P48740 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MASP1P48740 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MASP1P48740 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MASP1P48740 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MASP1P48740 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MASP1P48740 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MASP1P48740 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MASP1P48740 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MASP1P48740 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MASP1P48740 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MASP1P48740 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MASP1P48740 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MASP1P48740 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MASP1P48740 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MASP1P48740 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MASP1P48740 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MASP1P48740 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MASP1P48740 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MASP1P48740 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MASP1P48740 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MASP1P48740 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MASP1P48740 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MASP1P48740 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MASP1P48740 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MASP1P48740 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MASP1P48740 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MASP1P48740 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MASP1P48740 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MASP1P48740 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MASP1P48740 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MASP1P48740 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MASP1P48740 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MASP1P48740 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MASP1P48740 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MASP1P48740 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MASP1P48740 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MASP1P48740 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MASP1P48740 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MASP1P48740 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MASP1P48740 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MASP1P48740 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MASP1P48740 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MASP1P48740 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MASP1P48740 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MASP1P48740 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MASP1P48740 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MASP1P48740 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MASP1P48740 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MASP1P48740 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MASP1P48740 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MASP1P48740 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MASP1P48740 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MASP1P48740 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MASP1P48740 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MASP1P48740 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MASP1P48740 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MASP1P48740 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MASP1P48740 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MASP1P48740 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MASP1P48740 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MASP1P48740 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms