Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
MTHFRP42898 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFRP42898 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms