Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP2P42575 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP2P42575 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP2P42575 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP2P42575 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP2P42575 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP2P42575 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP2P42575 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP2P42575 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP2P42575 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP2P42575 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP2P42575 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP2P42575 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP2P42575 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP2P42575 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP2P42575 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP2P42575 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP2P42575 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP2P42575 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP2P42575 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP2P42575 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP2P42575 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP2P42575 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP2P42575 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP2P42575 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP2P42575 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP2P42575 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP2P42575 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP2P42575 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP2P42575 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP2P42575 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP2P42575 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP2P42575 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP2P42575 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP2P42575 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP2P42575 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP2P42575 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP2P42575 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP2P42575 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP2P42575 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP2P42575 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP2P42575 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP2P42575 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP2P42575 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP2P42575 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP2P42575 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP2P42575 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP2P42575 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP2P42575 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP2P42575 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP2P42575 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP2P42575 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP2P42575 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP2P42575 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP2P42575 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP2P42575 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP2P42575 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP2P42575 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP2P42575 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP2P42575 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP2P42575 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP2P42575 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP2P42575 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP2P42575 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP2P42575 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP2P42575 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP2P42575 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP2P42575 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP2P42575 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP2P42575 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP2P42575 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP2P42575 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP2P42575 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP2P42575 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP2P42575 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP2P42575 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP2P42575 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP2P42575 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP2P42575 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP2P42575 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP2P42575 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP2P42575 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP2P42575 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP2P42575 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP2P42575 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP2P42575 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP2P42575 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP2P42575 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP2P42575 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP2P42575 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP2P42575 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP2P42575 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP2P42575 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP2P42575 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP2P42575 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP2P42575 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP2P42575 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP2P42575 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP2P42575 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP2P42575 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms