Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIA2P42262 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIA2P42262 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms