Protein–RNA interactions for Protein: P32881

IFNA8, Interferon alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA8P32881 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNA8P32881 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms