Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA6P31267 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA6P31267 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms