Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
KDM5AP29375 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
KDM5AP29375 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5AP29375 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms