Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRBP23467 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
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