Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASTP20810 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CASTP20810 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASTP20810 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASTP20810 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASTP20810 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASTP20810 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASTP20810 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASTP20810 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASTP20810 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASTP20810 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASTP20810 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASTP20810 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASTP20810 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASTP20810 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASTP20810 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASTP20810 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASTP20810 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASTP20810 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASTP20810 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASTP20810 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CASTP20810 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CASTP20810 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASTP20810 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASTP20810 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASTP20810 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASTP20810 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASTP20810 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASTP20810 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASTP20810 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CASTP20810 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASTP20810 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASTP20810 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASTP20810 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASTP20810 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASTP20810 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASTP20810 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASTP20810 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASTP20810 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASTP20810 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASTP20810 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASTP20810 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASTP20810 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASTP20810 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASTP20810 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASTP20810 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASTP20810 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASTP20810 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASTP20810 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASTP20810 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASTP20810 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASTP20810 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASTP20810 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASTP20810 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASTP20810 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASTP20810 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CASTP20810 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASTP20810 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASTP20810 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASTP20810 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASTP20810 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASTP20810 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASTP20810 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASTP20810 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASTP20810 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASTP20810 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CASTP20810 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CASTP20810 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASTP20810 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASTP20810 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASTP20810 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASTP20810 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASTP20810 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASTP20810 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASTP20810 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASTP20810 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASTP20810 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASTP20810 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASTP20810 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASTP20810 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASTP20810 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASTP20810 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CASTP20810 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CASTP20810 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CASTP20810 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASTP20810 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASTP20810 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASTP20810 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CASTP20810 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASTP20810 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CASTP20810 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASTP20810 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CASTP20810 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CASTP20810 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASTP20810 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASTP20810 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASTP20810 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASTP20810 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASTP20810 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASTP20810 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms